發(fā)簡信
IP屬地：香港
在做monocle3的最后需要在圖中顯示軌跡，會用到plot_cells這個函數(shù)，如 plot_cells(cds, label_groups_...
從文章中下載的數(shù)據(jù)往往是一個表達矩陣和metadata.txt，如何使用這兩個數(shù)據(jù)呢？ 讀入表達矩陣，創(chuàng)建seurat對象nature<-rea...
1.在Python上用scanpy分析單細胞的時候，做到sc.pp.calculate_qc_metrics(adata, qc_vars=['...
在seurat分析單細胞數(shù)據(jù)的時候，用了PercentageFeatureSet這個函數(shù)，報錯了： Error in h(simpleError...
從文章里下的RNA-seq的數(shù)據(jù)分析，在做到sam轉(zhuǎn)bam這一步時候報錯，我先用的代碼是samtools sort -O BAM -o d2_r...
服務器版本：Centos7.8 1.root權(quán)限創(chuàng)建一個叫shiny的用戶useradd shinypasswd shiny2.賦予shiny用...
解決方法conda install -c conda-forge imagemagick再重新運行install.packages("ggima...
這篇文章主要介紹做RNA Velocity需要怎么做，至于原理請參考原文章 在做RNA速率之前需要先準備loom文件，換句話說就是要完成RNA速...
Seurat 格式轉(zhuǎn)換成SingleCellExperimentlibrary(sceasy)sceasy::convertFormat(seu...