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  • @醫(yī)學和生信筆記 哈哈哈哈我剛看到評論,這么說我,我太不服氣了,立馬怒沖沖打開R,結(jié)果利索裝上了??

    新版TCGA的突變SNP數(shù)據(jù)下載和整理

    關(guān)于TCGAbiolinks包的學習前面一共介紹了5篇推文。 今天繼續(xù)學習如何使用TCGAbiolinks下載和整理MAF格式的突變數(shù)據(jù)。 之前的TCGA的MAF文件是可以下...

  • 但是安裝TCGAbiolinks一直出錯,dependency包已經(jīng)從CRAN remove掉了

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  • 不用盲猜,看看count2TPM的源代碼就知道有沒有l(wèi)og的計算;并且,如果有0會報錯,像UCSC上那樣log2(x+1)處理之后,0的地方還是0,不還是一樣會報錯?

    【R>>IOBR】counts轉(zhuǎn)TPM

    分析測序數(shù)據(jù)時,常常需要將counts數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為TPM格式,而這個轉(zhuǎn)變過程就需要涉及每個基因的長度,幸好有專業(yè)人士已經(jīng)幫我們處理好這個東東,我們可以一鍵進行操作。首先來認識下...

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