@醫(yī)學(xué)和生信筆記 哈哈哈哈我剛看到評(píng)論，這么說我，我太不服氣了，立馬怒沖沖打開R，結(jié)果利索裝上了??
新版TCGA的突變SNP數(shù)據(jù)下載和整理關(guān)于TCGAbiolinks包的學(xué)習(xí)前面一共介紹了5篇推文。 今天繼續(xù)學(xué)習(xí)如何使用TCGAbiolinks下載和整理MAF格式的突變數(shù)據(jù)。 之前的TCGA的MAF文件是可以下...
IP屬地：上海
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但是安裝TCGAbiolinks一直出錯(cuò)，dependency包已經(jīng)從CRAN remove掉了
新版TCGA的突變SNP數(shù)據(jù)下載和整理
關(guān)于TCGAbiolinks包的學(xué)習(xí)前面一共介紹了5篇推文。 今天繼續(xù)學(xué)習(xí)如何使用TCGAbiolinks下載和整理MAF格式的突變數(shù)據(jù)。 之前的TCGA的MAF文件是可以下...
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不用盲猜，看看count2TPM的源代碼就知道有沒有l(wèi)og的計(jì)算；并且，如果有0會(huì)報(bào)錯(cuò)，像UCSC上那樣log2（x+1）處理之后，0的地方還是0，不還是一樣會(huì)報(bào)錯(cuò)？
【R>>IOBR】counts轉(zhuǎn)TPM
分析測(cè)序數(shù)據(jù)時(shí)，常常需要將counts數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為TPM格式，而這個(gè)轉(zhuǎn)變過程就需要涉及每個(gè)基因的長度，幸好有專業(yè)人士已經(jīng)幫我們處理好這個(gè)東東，我們可以一鍵進(jìn)行操作。首先來認(rèn)識(shí)下...