R/qtl是一個(gè)可擴(kuò)展的、交互的、用于QTL定位的R包，集數(shù)據(jù)分析和繪圖于一體。特點(diǎn)是使復(fù)雜的QTL定位方法被廣泛使用，使用戶專注于建模而不是計(jì)算。 官網(wǎng)：https://r...
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1.QTL定位：Rqtl—— Single-QTL analysis -
9.5 GWAS顯著SNP篩選及曼哈頓圖繪制在R中進(jìn)行整理，pmap格式在下面帖子中有詳細(xì)介紹。第一列為SNP的ID，第二列為chr，第三列為SNP的位置，第四列開始為每個(gè)性狀的SNP的P值。9.3 GWAS：關(guān)聯(lián)分析...
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CMplot報(bào)錯(cuò)missing value where TRUE/FALSE needed今天在使用CMplot畫曼哈頓圖時(shí)遇到一個(gè)bug：Error in if (sum(pvalueT <= 0) != 0 || sum(pvalueT > 1) != 0) ...
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作圖群體概念及分類介紹這是很多年前做的關(guān)于作圖群體的PPT，懶得再排版了，直接截圖上傳了，需要PPT的可以私信小編。在介紹作圖群體前我們先看一下之類性狀和數(shù)量性狀的差別： 當(dāng)然還要知道幾個(gè)基本的概...
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種群動(dòng)態(tài)歷史評估方法之 SFS（Site/Allele Frequency Spectrum）SFS的基本理解、介紹的一篇文章：https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...
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一文看懂三代組裝軟件——Flye
作者：童蒙編輯：angelica 一、介紹 Flye是用于單分子組裝數(shù)據(jù)的denovo基因組裝的軟件。這個(gè)軟件可以用于各種數(shù)據(jù)集，從小的細(xì)菌到大的哺乳動(dòng)物。 輸入是原始的Pa...
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名詞講解：轉(zhuǎn)座子（TE）、LTR、假基因轉(zhuǎn)座子參考[http://blog.sciencenet.cn/blog-1509670-1205415.html]轉(zhuǎn)座子數(shù)據(jù)庫 Trep[http://botserv2.u...
