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snpEFF 使用小tip安裝： 構(gòu)建注釋庫 (1)由于課題中加了點(diǎn)變動，注釋信息有些改變，需要自己創(chuàng)建庫 首先 在snpEFF 文件夾下創(chuàng)建data 文件夾 (2)隨后在里面分別創(chuàng)建 genomes...
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機(jī)器學(xué)習(xí)分類方法小結(jié)
最近要開始做一個(gè)分類器，因此，參考了幾篇文獻(xiàn)，并在自己的數(shù)據(jù)上進(jìn)行了測試，可用。1. 數(shù)據(jù)當(dāng)然了，需要準(zhǔn)備兩個(gè)數(shù)據(jù)集合，一個(gè)數(shù)據(jù)集合作為訓(xùn)練集合（train_dat），另一個(gè)...
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公眾號 R語言數(shù)據(jù)分析指南，歡迎大家關(guān)注
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copynumber
copynumber 是一個(gè)功能強(qiáng)大拷貝數(shù)分析工具，這里僅限于自己用的的部分功能，看到可用hg38版本，就嘗試運(yùn)行了一下，識別CNV break points。
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pip install 鏡像
最近安裝tensorflow 總是很慢，找了幾個(gè)鏡像，自己備份一下，在linux 服務(wù)器上安裝時(shí)，記得用https pip3 install --user -i http...
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breakdancer-CNV
在安裝時(shí)，使用conda 進(jìn)行安裝， conda install -y breakdancer 安裝完，運(yùn)行 bin/bam2cfg.pl 報(bào)錯 是沒有安裝這個(gè)Statist...
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在火山圖上標(biāo)記基因要玩圖，離不開哈德雷大神的《R數(shù)據(jù)科學(xué)》，第1章和21章是專門講圖的，我寫過對應(yīng)的筆記：http://m.itdecent.cn/p/4a154f6f0de7https...
