在做生信下游基因分析的時候，我們通常需要下載興趣基因的序列信息構(gòu)建進化書什么的，如果興趣基因比較少，那么可以直接在NCBI上搜索這個基因下載序列。但如果興趣基因很多，如果逐個...
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如何在NCBI批量下載基因家族序列？ -
TBtools基因家族分析詳細教程(3)基因家族成員的進化分析2基因-共線性的定義與常見算法原理 物種內(nèi)的共線性分析文件準備（物種比對到自身的.blast文件，物種基因信息文件.gff文件），運行MCScanX，輸出collinear和t...
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TBtools物種間共線性分析使用教程首先非常感謝CJ老師開發(fā)的TBtools工具，給生信分析帶來了極大的便利，詳細內(nèi)容介紹請參考http://m.itdecent.cn/p/f39bff6c4746 一 ...
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實驗1：總RNA的提取——Trizol實驗一：細胞中總RNA的提取及鑒定 一、目的：掌握Trizol提取總RNA的原理和步驟，學(xué)習(xí)電泳鑒定總RNA的方法。二、原理：RNA是核酸，具有較好的水溶性。提取RNA首先破...
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qRT-PCR 計算公式2–ΔΔCT (Livak) 方法當(dāng)我們做到熒光定量實驗時候，普遍采用操作簡便的2–ΔΔCT 法。 前提條件： 1. 使用2–ΔΔCT 法之前，必須驗證目標(biāo)基因和參照基因的擴增效率。目標(biāo)基因和參照基因擴增效率...
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qRT-PCR實驗及數(shù)據(jù)分析qRT-PCR實驗原理 RT-qPCR由普通PCR技術(shù)發(fā)展而來，它是在傳統(tǒng)PCR反應(yīng)體系中加入熒光化學(xué)物質(zhì)（熒光染料或者熒光探針），根據(jù)各自不同的發(fā)光機制實時檢測PCR退火、...
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qRT-PCR相對定量計算詳解做完轉(zhuǎn)錄組分析之后，一般都要求做qRT-PCR來驗證二代測序得到的轉(zhuǎn)錄本表達是否可靠。熒光定量PCR是一種相對表達定量的方法，他的計算方法有很多，常用的相對定量數(shù)據(jù)分析方法有...
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八行代碼搞定內(nèi)參基因篩選-R版本的NormFinder寫在前面 碩士畢業(yè)做的大豆內(nèi)參基因的篩選，當(dāng)時用了geNorm, NormFinder和BestKeeper三個軟件，geNorm 不需要多說，Vandesompele教授的...
