相信很多專題應(yīng)該已經(jīng)講過SCENIC的使用，這兒，針對(duì)我自己對(duì)SCENIC的學(xué)習(xí)使用，遇到的問題做一個(gè)詳細(xì)的講解說明，希望能對(duì)大家理解學(xué)習(xí)應(yīng)用SCENIC起到一些幫助。 SC...
發(fā)簡(jiǎn)信
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析工具（TF，motifs）-SCENIC -
2019-08-28第七天：關(guān)于SCENIC的使用教程
文章來源：scenic: single-cell regulatory network inference and clustering github 一、軟件安裝 安裝教程...
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seurat-ScaleData()源碼解析一、ScaleData()簡(jiǎn)介 單細(xì)胞基因表達(dá)counts矩陣數(shù)據(jù)經(jīng)過NormalizeData()歸一化處理后，還需要進(jìn)行scale標(biāo)準(zhǔn)化。ScaleData()[http...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)027--[sc]組織環(huán)境對(duì)中性粒細(xì)胞命運(yùn)的共同決定作用最近對(duì)中性粒細(xì)胞感興趣，就多讀了幾篇文章。分享的這一篇是20年的cell。 HighlightsNeutrophils have variable lifetimes in ...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)018--[sc]單細(xì)胞測(cè)序鑒定出特殊炎性巨噬細(xì)胞亞群可作為減輕急性腎臟損傷的治療靶點(diǎn)今年剛發(fā)在Advanced Science上的文章，影響因子16.806。 1. Mononuclear Phagocyte Atlas at Single-Cell Res...
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Seurat::DoHeatmap 的謎之報(bào)錯(cuò)Seurat::DoHeatmap 的謎之報(bào)錯(cuò) 最近在學(xué)習(xí)Seurat教程（Seurat版本3.0.2），發(fā)現(xiàn)運(yùn)行到倒數(shù)第二步做熱圖展示marker genes時(shí)總是報(bào)錯(cuò) 主...
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2021-06-23 3-5分 不需要實(shí)驗(yàn)的生信期刊（中科院預(yù)警的已經(jīng)排除）
大多數(shù)人應(yīng)該不是中科院預(yù)警就行，部分期刊可能是吉大一院預(yù)警。 bmc cancer, Cancer Medicine, Frontiers in Genetics, INTE...
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基因ID轉(zhuǎn)換方法總結(jié)1. clusterProfiler包，bitr()轉(zhuǎn)換ID函數(shù) clusterProfiler 是Y叔寫的一個(gè)功能強(qiáng)大的R包，可以用來做各種富集分析，如GO、KEGG、DO...
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meta分析/系統(tǒng)評(píng)價(jià)中單臂研究的偏倚風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià)單臂研究（single arm study）：即單組臨床試驗(yàn)，顧名思義，就是僅有一個(gè)組的研究，沒有為試驗(yàn)組設(shè)計(jì)相對(duì)應(yīng)的對(duì)照。部分文章取名為病例系列研究（case series...
