參考：https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/downloads/lates...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：康乃狄克州
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[Bio News] Cell Ranger - 7.0發(fā)布/2022年5月17號(hào) -
如何將RefSeq mRNA ID轉(zhuǎn)換為Entrez ID如何將RefSeq mRNA ID轉(zhuǎn)換為Entrez ID 同樣地，使用Ensembl的BioMart在線(xiàn)工具，在Filters那里選擇RefSeq mRNA ID(s)，然...
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生物信息學(xué)初學(xué)者應(yīng)該學(xué)什么
這是一個(gè)比較大的問(wèn)題了，希望能夠通過(guò)寫(xiě)下自己多年的經(jīng)驗(yàn)和感悟，幫助到需要幫助的人。 有些內(nèi)容也不局限于生物信息學(xué)，對(duì)于科研工作者而言，應(yīng)該都有一定幫助。 首先，先列一個(gè)小提綱...
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如何在R中以pdf格式批量輸出圖
應(yīng)用場(chǎng)景：比如說(shuō)我們有50個(gè)marker，需要輸出50張UMAP圖，每張圖上顯示一個(gè)marker的表達(dá)情況。 其中，myMarker是一個(gè)向量，為很多基因的Ensembl向量...
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思索（二）
人為什么不愿意放棄看上去就根本不可能的事情呢，因?yàn)樗麩o(wú)法面對(duì)一個(gè)事實(shí)：即使那些看上去很可能的事也是不確切或難以實(shí)現(xiàn)的，而猛烈追求不可能事物能讓他輕而易舉地回避自身。
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如何在R里面將Ensembl ID轉(zhuǎn)換為Gene Symbol
下面以人類(lèi)基因?yàn)槔?library('biomaRt')mart <- useDataset("hsapiens_gene_ensembl", useMart("ensem...
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文字、音頻和視頻，哪種媒介更合適自媒體
包含的信息越多，帶來(lái)的對(duì)想象力的限制也越大。 一開(kāi)始看到Emoji化的視頻，感覺(jué)非常好。想著如果自己在把聲音變一下，豈不是可以在網(wǎng)上直播爆爆料之類(lèi)，把自己聽(tīng)聞的一些重要消息爆...
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立志
立志非常重要，志不立，天下無(wú)可成之事。 學(xué)者大要立志。所謂志者，不道將這些意氣去蓋他人，只是直截要學(xué)堯舜?！懊献拥佬陨疲员胤Q(chēng)堯舜。”此是真實(shí)道理。“世子自楚反，復(fù)見(jiàn)孟子。孟...
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我想要一個(gè)家
我是一朵被流放的云， 背負(fù)著無(wú)情無(wú)義的罪名， 渴望一個(gè)溫暖的家庭， 我始終愛(ài)著遠(yuǎn)方的樹(shù)， 頻繁地想他， 我愿回到大地的懷抱， 不辭辛苦地流進(jìn)他的心，立刻定居。
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云與月
一片即將失去云的天空， 她抬頭看見(jiàn)了月亮。 生活像風(fēng)， 你我不在其中。 月映萬(wàn)川， 你我不在其中。 云是為月亮而來(lái)的。
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如果你認(rèn)為自己很努力了 你還可以更努力一點(diǎn) 挺過(guò)去，人生就會(huì)豁然開(kāi)朗
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該專(zhuān)題是機(jī)器學(xué)習(xí)、推薦系統(tǒng)和自然語(yǔ)言處理、深度學(xué)習(xí)相關(guān)算法學(xué)習(xí)記錄，用通俗的語(yǔ)言去理解算法，去樸實(shí)的文字記錄每次前行，每個(gè)算法力爭(zhēng)說(shuō)清緣由，且嘗試實(shí)現(xiàn)或者使用開(kāi)源庫(kù)進(jìn)行。機(jī)器學(xué)習(xí)忍者在路上……
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思索（一）
要學(xué)會(huì)放棄，盡可能地放棄你可以放棄的，你會(huì)發(fā)現(xiàn)人生開(kāi)始變得更加美好！ 有些人只有晚上熬夜才能把事情做完做好，是因?yàn)榘滋斓臅r(shí)候內(nèi)心散亂，不能靜。
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發(fā)表在Nature和Science上的算法文章（整理中）
有一些算法發(fā)表在Nature和Science上，值得整理和討論。 比如著名的非負(fù)矩陣分解算法： Learning the parts of objects by non-ne...
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什么是基因組學(xué)？
今天在讀文獻(xiàn)的時(shí)候，看到一段話(huà)， The key has been the recent ability to apply genomic profiling approac...
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生信技能樹(shù)：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公眾號(hào)：優(yōu)雅R 生物數(shù)據(jù)分析QA，技術(shù)文檔與博客，需要你的參與。 ……………………………… 歡迎在簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作和做筆記的生信學(xué)習(xí)者、愛(ài)好者以及相關(guān)編程人員加入本專(zhuān)題，貢獻(xiàn)你的文字，無(wú)論是原創(chuàng)還是筆記，我們需要你，將本專(zhuān)題打造為生信知識(shí)寶庫(kù)、交流平臺(tái)。 內(nèi)容可以是對(duì)生物信息學(xué)與算法知識(shí)相關(guān)資源的收集、整理，以及原創(chuàng)筆記： * R * Python * Perl * Linux 工具與編程 * 繪圖 * 統(tǒng)計(jì) * 計(jì)算生物學(xué) * 各類(lèi)算法 * 機(jī)器學(xué)習(xí)
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領(lǐng)域內(nèi)文獻(xiàn)資料新消息（生信、表觀，190316更新）
涉及的領(lǐng)域主要是生物信息學(xué)、計(jì)算生物學(xué)和表觀遺傳學(xué)，同時(shí)會(huì)關(guān)注機(jī)器學(xué)習(xí)、統(tǒng)計(jì)、干細(xì)胞生物學(xué)、發(fā)育生物學(xué)、遺傳學(xué)、精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)等方向。 因?yàn)榻?jīng)常去看新的發(fā)表的文章或者預(yù)印本，所以想...
