好多同學(xué)詢問孟德爾隨機(jī)化的問題，我再來嘗試著梳理一遍，希望對大家有所幫助，首先看下圖1分鐘，盯著看將下圖印在腦海中： [圖片上傳失敗...(image-9bf17c-1668...
發(fā)簡信
IP屬地：北京
-
R數(shù)據(jù)分析：孟德爾隨機(jī)化實(shí)操
-
除了GWAS Catalog，還可以用CAUSALdb數(shù)據(jù)庫做GWAS要查詢以往的 GWAS 研究結(jié)果，可以使用 GWAS Catalog。GWAS Catalog 包含的信息非常多，不過有時可能滿足不了需要。介紹一個叫 CAUSALdb 的數(shù)...
-
R數(shù)據(jù)分析：工具變量回歸與孟德爾隨機(jī)化，實(shí)例解析
原諒我又拖更好久，沒辦法，欸，就是懶，但是所有的單子都是保質(zhì)保量完成的哈。，今天給大家寫工具變量和孟德爾隨機(jī)化，文章略微有些長，請大家準(zhǔn)備好清醒的頭腦，和半個小時的閱讀時間哈...
-
孟德爾隨機(jī)化(Mendelian Randomization) 統(tǒng)計功效（power）和樣本量計算1 統(tǒng)計功效（power）概念 統(tǒng)計功效（power）指的是在原假設(shè)為假的情況下，接受備擇假設(shè)的概率。 用通俗的話說就是，P<0.05時，結(jié)果顯著（接受備擇假設(shè)）; 在此結(jié)論...
-
TwoSampleMR：兩樣本孟德爾隨機(jī)化孟德爾隨機(jī)化推斷暴露因素與健康結(jié)局的因果關(guān)系[http://m.itdecent.cn/p/8ac31267d3d8] 主要步驟：1. 讀取暴露因素GWAS數(shù)據(jù)選取合適...
-
參考文獻(xiàn)排版，這幾點(diǎn)非常重要！之前和大家多次聊過參考文獻(xiàn)的排版。?? Zotero | 有了Zotero，參考文獻(xiàn)排版不再煩惱！ 定制版GB/T 7714來了，究竟有多好用？| Zotero 今天繼續(xù)介紹...
-
熱圖 | 轉(zhuǎn)錄組樣品表達(dá)量相關(guān)系數(shù)矩陣寫在前面 很多時候，我們做完轉(zhuǎn)錄組，會想著看看樣品與樣品之間的表達(dá)相關(guān)性如何？依此，可以看看是否存在異常樣品，也或許可以找到一些生物學(xué)相關(guān)問題。常常，我會使用 R 語言的 C...
-
基于R語言繪制Network幾種方式平時對于網(wǎng)絡(luò)圖的繪制，一般我們都會在R中生成邊和點(diǎn)列表后導(dǎo)入到Cytoscape和Gephi等的本地工具軟件當(dāng)中，而R語言中也自帶有不少優(yōu)秀的包也可精美的可視化我們的數(shù)據(jù)，所...
-
GOplot | 更美觀的富集分析可視化GOplot | 更美觀的富集分析可視化 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 GOplot使用了zscore概念，但其并不是指Z-score標(biāo)準(zhǔn)化，而是指每個GO term下上調(diào)(logFC>0)基因...
