發(fā)簡信
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將ENA下載的MD5值轉(zhuǎn)化成md5sum可以識別的格式
本腳本可以將從ENA下載的MD5文件（如下） 轉(zhuǎn)化成md5sum 可以識別的格式 代碼如下
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featureCounts 統(tǒng)計BAM文件中每個基因匹配的reads數(shù)
Subread package: high-performance read alignment, quantification and mut...
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Conda 以及 Snakemake 安裝及使用防止自己下次忘了，作為筆記使用，整理自網(wǎng)絡(luò)。參考自Snakemake：簡單好用的生信流程搭建工具 | | 百邁客生物 (biomarker.co...
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根據(jù)Eggnog注釋信息構(gòu)建orgDb數(shù)據(jù)庫并進行GO、KEGG分析
本文大部分內(nèi)容來源于網(wǎng)絡(luò)，寫此文章僅是為了自己后面查找方便，如有侵權(quán)，聯(lián)系刪除。參考來自于：自己構(gòu)建物種包OrgDb，然后用clusterPro...
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DESeq2+clusterProfiler使用流程（以玉米B73_v3數(shù)據(jù)為例）
DESeq2+clusterProfiler使用 讀取featureCounts的reads統(tǒng)計結(jié)果，存儲與countData矩陣中 設(shè)置樣品信...
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利用snpEff對snp vcf 信息進行注釋
利用snpEff軟件可以對獲得的snp信息進行注釋，以確定該snp對于基因編碼信息的影響：同義替換、非同義替換、非編碼區(qū)等等 首先查看snpef...
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利用MMAPPR進行BSR分析流程
1. 安裝軟件 1.1. 下載安裝MMAPPR 1.2. 下載安裝USeq軟件 2. 構(gòu)建參考基因組索引 該索引用于后面Hisat2比對 3. ...