【原創(chuàng)】R語言實戰(zhàn)：read counts如何轉(zhuǎn)化為TPM和FPKM, TPM和FPKM相互轉(zhuǎn)化
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reads counts轉(zhuǎn)化為fpkm和tpm值
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pigz多線程壓縮工具&scp斷點續(xù)傳
1.pigz多線程壓縮工具 使用conda安裝 多線程壓縮 多線程解壓 2.scp服務(wù)器間傳文件及斷點續(xù)傳 服務(wù)器間傳送文件 若傳送的文件很大，又偶遇斷網(wǎng)或停電，scp可以斷點續(xù)傳
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基因家族分析 | 番茄Nramp基因家族分析（二）
系列目錄：基因家族分析 | 番茄Nramp基因家族分析（一）基因家族分析 | 番茄Nramp基因家族分析（二） 通過上一部分的分析得到了以下數(shù)據(jù)： 接下來利用獲得的這些數(shù)據(jù)進(jìn)...
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ggpubr：快速繪制用于發(fā)表的圖形更好的閱讀體驗-->> ggplot2 (Hadley Wickham開發(fā))是目前R語言數(shù)據(jù)可視化的主流。與R的基礎(chǔ)繪圖系統(tǒng)相比，基于grid繪圖系統(tǒng)的ggplot2已經(jīng)在語...
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paleobiodb&timetree查找物種分化時間構(gòu)分歧時間樹的時候，找化石標(biāo)定點，除了可以找文獻(xiàn)，也可以來這倆網(wǎng)站瞅瞅 paleobiodb古生物化石數(shù)據(jù)庫 網(wǎng)址：https://www.paleobiodb.org/ 種...
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轉(zhuǎn)錄組有參分析之STAR比對及可變剪切
轉(zhuǎn)錄組有參分析之STAR比對及可變剪切 STAR比對的特點： 速度快 準(zhǔn)確度高 3'reads soft clip genomeLoad LoadAndKeep 多個比對共享...
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幾個預(yù)測蛋白結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)的在線工具
1.預(yù)測理化性質(zhì)：分子量(Da)、等電點(PI)\不穩(wěn)定系數(shù)(Instability index)、親水指數(shù)(Grand average of hydropathicity-...
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SignalP 5.0：信號肽預(yù)測信號肽（signal peptides）：是引導(dǎo)新和成的蛋白質(zhì)向分泌通路轉(zhuǎn)移的短肽鏈，長度約5-30個氨基酸；對應(yīng)的mRNA序列，在起始密碼子后，有一段編碼疏水性氨基酸序列的...
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生信小工具專題：BBTools/BBMap Suite 的使用 (1)
不會編程的小白通常會煩惱怎樣去處理一些簡單的數(shù)據(jù)統(tǒng)計，不要緊其實日常我們用到百分之80以上的數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析，都已經(jīng)有人幫我們將輪子造好了，只要我們學(xué)會怎樣利用好這些工具，很多事...
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@原諒我的不辭而別 自己找到的所有的目標(biāo)物種NBS所有的domain序列
基因家族分析 | 基因家族成員鑒定(hmm模型＆同源blast)
方法一：基于hmm模型的鑒定方法 1.準(zhǔn)備數(shù)據(jù)①下載擬南芥基因組fasta文件、注釋文件gtf/gff3文件：ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub...
