你這也不是單細(xì)胞呀,ssGSEA吧
利用單細(xì)胞集合做免疫浸潤(rùn)分析以前一直用經(jīng)典的MCP法分免疫浸潤(rùn) 總感覺(jué)不好 上篇文章上也寫過(guò) 這次用腸癌單細(xì)胞6萬(wàn)多的細(xì)胞的特異性基因,特異性基因我是一個(gè)一個(gè)看的,我選的標(biāo)準(zhǔn)是logfc大于1,而且如果...
你這也不是單細(xì)胞呀,ssGSEA吧
利用單細(xì)胞集合做免疫浸潤(rùn)分析以前一直用經(jīng)典的MCP法分免疫浸潤(rùn) 總感覺(jué)不好 上篇文章上也寫過(guò) 這次用腸癌單細(xì)胞6萬(wàn)多的細(xì)胞的特異性基因,特異性基因我是一個(gè)一個(gè)看的,我選的標(biāo)準(zhǔn)是logfc大于1,而且如果...
現(xiàn)在這個(gè)包好像R包好像有點(diǎn)問(wèn)題,處理數(shù)據(jù)的時(shí)候回出錯(cuò)
TCGA數(shù)據(jù)挖掘(一):TCGAbiolinks包介紹腫瘤基因組圖譜(TCGA)計(jì)劃是由美國(guó)National Cancer Institute(NCI)和National Human Genome Research Instit...
背景: 染色質(zhì)和染色體的結(jié)構(gòu)和功能 每一條染色單體由單個(gè)線性DNA分子組成。細(xì)胞核中的DNA是經(jīng)過(guò)高度有序的包裝,否則就是一團(tuán)亂麻,不利于DNA復(fù)制和表達(dá)調(diào)控。這種有序的狀態(tài)...
管于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)下載,我們之前有介紹過(guò)R語(yǔ)言下載包:R語(yǔ)言TCGA-Assembler包下載TCGA數(shù)據(jù),同時(shí)在介紹數(shù)據(jù)庫(kù)的使用教程中也介紹了在線下載以及官方下載工...
腫瘤基因組圖譜(TCGA)計(jì)劃是由美國(guó)National Cancer Institute(NCI)和National Human Genome Research Instit...
? 腫瘤內(nèi)刺激樹突狀細(xì)胞(SDC)在刺激細(xì)胞毒性T細(xì)胞和誘導(dǎo)抗腫瘤免疫反應(yīng)中起著重要的作用。了解調(diào)節(jié)它們?cè)谀[瘤微環(huán)境(TME)中的豐度的機(jī)制可以揭示新的治療機(jī)會(huì)。作者發(fā)現(xiàn),在...