作者：Arno
審稿：童蒙
編輯：amethyst
今天給大家介紹一款可以用于編程和寫作的web集成的交互計(jì)算環(huán)境jupyter。作為一枚生物信息攻城獅，數(shù)據(jù)分析時(shí)經(jīng)常需要寫寫代碼和文檔，相信同行對(duì)jupyter都有所了解，或者非常熟悉。之前周圍小伙伴一直都在使用的是jupyter notebook，后來(lái)更新?lián)Q代到了jupyter lab。
jupyter lab包含了jupyter notebook的所有功能，并升級(jí)增加了很多功能。其支持python、R、java等多種編程語(yǔ)言及markdown、letex等寫作語(yǔ)言及公式輸入，可以集編程與寫作于一身，非常適合于代碼學(xué)習(xí)，筆記記錄、演示及教學(xué)等。jupyter lab相比notebook最大的更新是模塊化的界面，可以在同一個(gè)窗口以標(biāo)簽的形式同時(shí)打開好幾個(gè)文檔，同時(shí)插件管理非常強(qiáng)大，使用起來(lái)要比jupyter notebook高大尚許多。如果還不了解jupyter lab的，就跟著小編一起學(xué)起來(lái)吧。
jupyter安裝及啟動(dòng)
為了方便所有人使用，今天就主要跟大家介紹一下jupyter在Windows系統(tǒng)的安裝。jupyter的安裝，推薦大家直接下載Anaconda安裝使用。Anaconda集成了生物信息分析常使用的絕大部分的模塊包，包含了conda、Python、jupyter等180多個(gè)科學(xué)包及其依賴項(xiàng)。上手簡(jiǎn)單，可以直接使用python中的各種類庫(kù)模塊等，基本不再需要額外的模塊包的安裝。
直接進(jìn)入Anaconda的官網(wǎng)，選擇對(duì)應(yīng)的版本（Windows_64-Bit/32-Bit）進(jìn)行下載。軟件的安裝比較簡(jiǎn)單，這里就不再進(jìn)行演示了，安裝時(shí)建議大家放到純英文路徑下，且不要帶有空格等特殊符號(hào)，以免不方便使用。
安裝完Anaconda之后，jupyter notebook和jupyter lab便都可以使用了，大家可以在Anaconda安裝路徑的Scripts目錄下找到對(duì)應(yīng)的執(zhí)行程序，也可以在開始菜單中搜索找到。這里推薦大家使用cmd進(jìn)行命令行使用jupyter lab（WIN+R打開運(yùn)行輸入cmd即可進(jìn)行命令行）。直接在命令行中輸入jupyter-lab即可直接啟動(dòng)即可，如果想在特定目錄下運(yùn)行，可以直接在后邊跟上目錄即可，注意目錄不要有空格等特殊符號(hào)。
## 默認(rèn)路徑啟動(dòng)
jupyter-lab
## 指定路徑啟動(dòng)
jupyter-lab C:\Users\lenovo\Desktop\jupyter-test\Python
jupyter-lab功能介紹
啟動(dòng)之后，就進(jìn)入了jupyter-lab的模塊化管理界面，可以從管理界面選擇進(jìn)行創(chuàng)建jupyter的ipynb文檔、純markdown文檔、txt文檔等，也可以直接打開python3的console執(zhí)行python的命令行，還可以直接啟動(dòng)命令行終端（Terminal），執(zhí)行Windows命令行操作。
jupyter-lab內(nèi)嵌了ipython的內(nèi)核，添加了python3的控制端console，可以直接打開當(dāng)做python3的idle來(lái)使用。還可以在編輯txt文本時(shí)，隨時(shí)創(chuàng)建console，非常方便的的運(yùn)行文本文件中的任何代碼。
jupyter-lab可以直接寫markdown的文檔，并且可以邊撰寫邊預(yù)覽，使用起來(lái)還是比較方便的。另外還支持Excel、json、html、latex、pdf等類型的文件。
除此之外，jupyter-lab還可以直接打開Windows的Terminal終端，進(jìn)行使用。在cmd的終端中輸入powershell，還可以打開win10自帶的linux子系統(tǒng)，方便的使用linux系統(tǒng)。
當(dāng)然最重要的，還是使用jupyter-lab編輯ipynb文檔， 可以以代碼單元格為單元運(yùn)行，實(shí)時(shí)顯示中間過(guò)程及變量，非常方便的交互式使用。
jupyter-lab使用技巧
jupyter-lab的使用非常便捷，交互式的界面非常友好，再掌握一些常用的使用技巧之后就會(huì)非常高效。這里大致總結(jié)了技巧的幾個(gè)方向，感興趣的可以自己先去嘗試，后邊我們也會(huì)逐一去詳細(xì)介紹。
jupyter-lab拓展性非常強(qiáng)，目前有比較豐富的插件可供使用，比如代碼補(bǔ)全的插件、代碼調(diào)試器插件、github相關(guān)的插件、Excel相關(guān)的插件、畫圖相關(guān)的插件等等，安裝也非常的便捷。
jupyter-lab擁有魔法函數(shù)，可以簡(jiǎn)單的實(shí)現(xiàn)一些復(fù)雜的功能。如果要調(diào)用外部的python腳本、實(shí)時(shí)顯示python命令行的運(yùn)行進(jìn)度，運(yùn)行時(shí)間等均可以使用魔法函數(shù)。
jupyter-lab快捷鍵，任何一個(gè)工具，能夠熟練的使用快捷鍵都會(huì)大大提高使用效率。jupyter-lab也設(shè)置了很多的快捷鍵，一些常用的還是很有必要用起來(lái)的。
jupyter-lab鏈接了很多軟件、模塊的官方使用文檔，可以在ipynb的文件窗口，查看點(diǎn)擊Help。可以看到鏈接了有包括Jupyter、Markdown、Python3在內(nèi)的十幾個(gè)官方使用文檔，方便大家查看學(xué)習(xí)。
