2024年3月1日更新 推薦直接用最近的新軟件PanDepth[https://github.com/HuiyangYu/PanDepth]，C語言寫的，速度很快。 以下為舊...
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二代測序通過bam文件統(tǒng)計深度和覆蓋度 -
蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法
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「群體遺傳學(xué)實(shí)戰(zhàn)」第三課: 如何對SNP位點(diǎn)進(jìn)行過濾
往期教程 「群體遺傳學(xué)實(shí)戰(zhàn)」第一課: 對SNP位點(diǎn)進(jìn)行注釋 「群體遺傳學(xué)實(shí)戰(zhàn)」第二課: 畫出和文章幾乎一樣的PCA圖 SNP位點(diǎn)過濾 SNP過濾有兩種情況，一種是僅根據(jù)位點(diǎn)質(zhì)...
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公眾號 R語言數(shù)據(jù)分析指南，歡迎大家關(guān)注
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中科院遺傳發(fā)育所在讀博士，研究水稻。關(guān)注植物免疫和群體遺傳進(jìn)化，經(jīng)常摸魚學(xué)生信。同名CSDN分享代碼，歡迎圍觀~
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跟著Cell學(xué)作圖：R語言ggplot2作圖展示差異表達(dá)的基因一組對照加處理這種實(shí)驗(yàn)的差異表達(dá)分析結(jié)果通常是用火山圖來展示，如果是很多組實(shí)驗(yàn)的話如何展示，這種情況我之前還沒有遇到過。公眾號后臺有讀者留言問到了如下的圖 這個圖來自于論文A...
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R語言之tidyverse包安裝瀏覽了各大網(wǎng)站關(guān)于tidyverse包的安裝，初步安裝成功，教程分享如下，如有不正確的地方還請多多指教 第一步：下載tidyverse包，鏈接：https://cran.r-...
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2020-12-17水稻、小麥GO富集分析RNAseq常規(guī)做法是先篩選出差異表達(dá)基因，然后針對篩選出來的差異基因做GO富集分析。 1.水稻、小麥GO信息提取 在進(jìn)行GO富集分析前首先要確定在你所使用的GO富集分析軟件...
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m6a RNA甲基化測序分析流程 rna甲基化研究方法
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收錄比較基因組學(xué)，進(jìn)化基因組學(xué)，群體基因組學(xué)，分子進(jìn)化，及相關(guān)領(lǐng)域的各類文章。特別地。由于是簡書，建樹的內(nèi)容當(dāng)然是必不可少了。 歡迎大家投稿
