IP屬地：海南
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周運(yùn)來(lái)，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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KEGG分析工具：pathview基本操作什么是KEGG KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系統(tǒng)分析基因功能、基因組信息數(shù)據(jù)庫(kù)，它有助于研究者把基因及表達(dá)信息...
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用Amelia函數(shù)進(jìn)行時(shí)間序列變量的多重插補(bǔ)模擬練習(xí)數(shù)據(jù) abs(x)取x的絕對(duì)值round（x）取x的整數(shù) 進(jìn)行插補(bǔ) 查看插補(bǔ)效果 下圖紅點(diǎn)是插補(bǔ)的值，紅線是其置信范圍可見(jiàn)置信范圍較大，插補(bǔ)的效果不好 考慮時(shí)間因素，...
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通過(guò)mice包進(jìn)行多重插補(bǔ)基于mice包的分析通常符合以下分析過(guò)程： 其中， data是一個(gè)包含缺失值的矩陣或數(shù)據(jù)框。 imp是一個(gè)包含m個(gè)插補(bǔ)數(shù)據(jù)集的列表對(duì)象，同時(shí)還含有完成插補(bǔ)過(guò)程的信息。 默認(rèn)m...
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對(duì)缺失數(shù)據(jù)進(jìn)行探索一、 對(duì)缺失數(shù)據(jù)進(jìn)行探索 主要使用VIM和mice包。命令install.packages(c("VIM","mice"))可下載并安裝這兩個(gè)軟件包。并使用VIM包提供的哺乳...
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實(shí)驗(yàn)技能方面1. PCR：（聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)）是通過(guò)PCR儀，模擬DNA半保留復(fù)制，從而體外快速擴(kuò)增DNA的方式。 一、基本過(guò)程 典型的PCR包括高溫變性、低溫退火、中溫延伸三個(gè)步驟，通過(guò)...
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TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)學(xué)習(xí)之其他數(shù)據(jù)庫(kù)1. GTEX數(shù)據(jù)庫(kù)：正常人的各個(gè)組織的轉(zhuǎn)錄表達(dá)和基因型 數(shù)據(jù)一般來(lái)源于意外死亡的正常人人體組織做TCGA數(shù)據(jù)分析時(shí)一般會(huì)拿GTEX的數(shù)據(jù)作為正常對(duì)照 2. UCSC Xen...
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熒光PCR
1. 分裝病毒 保存于進(jìn)口EP管，300u 一個(gè)封裝前充分震蕩保存液 2. 機(jī)提核酸 準(zhǔn)備深96孔板、試劑盒、樣品300u、陽(yáng)性對(duì)照（fluA、fluB） 96孔板中加入：第...
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apply函數(shù)族+split+by
引用自R語(yǔ)言向量化運(yùn)算之a(chǎn)pply函數(shù)族+split+by：https://blog.csdn.net/qq_38984677/article/details/8167655...
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TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)學(xué)習(xí)之網(wǎng)頁(yè)工具1. TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)包含信息： 2. 網(wǎng)頁(yè)工具： 儲(chǔ)存數(shù)據(jù)的： 看某個(gè)基因在癌癥中是否有生存相關(guān)性： 腫瘤中差異基因的表達(dá)量數(shù)據(jù)庫(kù)：GEPIGEPI Lnc RNA數(shù)據(jù)庫(kù)：現(xiàn)...
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2019-09-27 DAY-5 ggplot之統(tǒng)計(jì)變換與位置調(diào)整 孤傲的小籠包關(guān)于diamonds數(shù)據(jù)集ggplot2內(nèi)置數(shù)據(jù)集，包含53940顆鉆石的信息。carat：克拉cut：切割質(zhì)量color：顏色等級(jí)clarity：純凈度等級(jí)depth：深度...
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2019-09-26 DAY-4、5 R語(yǔ)言之ggplot 孤傲的小籠包mpg數(shù)據(jù)集的內(nèi)容1.manufacturer：生產(chǎn)商 15個(gè)2.model：型號(hào) 38個(gè)3.displ：引擎排量-L 35個(gè)，單位為升，小數(shù)4.year：出廠年份5.cly...
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2019-09-25 DAY-3 linux 下的軟件安裝 孤傲的小籠包
conda--“l(fā)inux的應(yīng)用商店” 1. 檢查有沒(méi)有bzip2（一個(gè)壓縮軟件） 直接輸入bzip2，如果有會(huì)顯示 輸入yum install -y bzip2可以安裝 2...
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2019-09-23 DAY-1 MARKDOWN語(yǔ)法學(xué)習(xí)筆記 孤傲的小籠包學(xué)習(xí)MARKDOWN語(yǔ)法和簡(jiǎn)書筆記( ?? ω ?? )? 6級(jí)標(biāo)題格式：使用# / ## / ### / ####等 列表:http://m.itdecent.cn/...
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2019-09-29 DAY-7 測(cè)序知識(shí) 孤傲的小籠包測(cè)序歷史 文章-《測(cè)序的世界》 測(cè)序數(shù)據(jù)格式 1. Fastq和Fasta格式 Fastq文件→Fasta文件Linux命令法1：sed '/^@/!d;s//>/;N' y...
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2019-09-28 DAY-6 Tidy Data 孤傲的小籠包學(xué)會(huì)獲取一個(gè)包的小抄 方法1：去百度/谷歌XX小抄方法2：找Rstudio的cheatsheet網(wǎng)站（網(wǎng)速好慢的） 一，新建數(shù)據(jù)框 a<-data.frame(GeneId ...
