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干貨 | 如何利用RNA-seq數(shù)據(jù)分析病毒整合情況？哈嘍大家好，好久不見。因?yàn)橐咔樵蚝芏嘈』锇閭円呀?jīng)居家辦公很久了，大家可能也在思考一個(gè)問題：在宅家期間沒有辦法做實(shí)驗(yàn)的情況下、如何利用公共數(shù)據(jù)庫...
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干貨 | 如何對(duì)fastq文件進(jìn)行批量處理？
哈嘍，大家好，好久不見，今日分享代碼如題——如何對(duì)fastq文件進(jìn)行批量處理？以RNAseq為例。首先大家可以回顧一下小編之前關(guān)于RNAseq數(shù)...
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干貨 | 一文教會(huì)你如何分析ATAC-seq數(shù)據(jù)
哈嘍大家好，好久沒有跟新啦，小編最近面臨博士三年級(jí)畢業(yè)的壓力，所以公眾號(hào)都沒時(shí)間打理了，不過偶爾還是能看到有人關(guān)注我的公眾號(hào)或者留言，還是很受鼓...
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分享 | ATAC-seq建庫protocol
哈嘍大家好，前面小編和大家分享了ATAC-seq數(shù)據(jù)分析的流程，那么，ATAC-seq建庫是否也可以DIY呢？下面就和大家分享一則ATAC-se...
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干貨 | 一文教會(huì)你如何采用Linux系統(tǒng)處理RNAseq測序數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)錄組是指細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和。轉(zhuǎn)錄組測序（Transcriptome sequencing）是基于Illumina ...
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干貨 | 一文教會(huì)你如何使用VMware安裝CentOS虛擬機(jī)
在學(xué)習(xí)生物信息學(xué)的過程中，不可避免的會(huì)經(jīng)常接觸到Linux系統(tǒng)，畢竟生物信息學(xué)軟件大多都是基于Linux系統(tǒng)開發(fā)的，尤其對(duì)于生物大數(shù)據(jù)的處理如原...
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干貨 | 兩行代碼教你輕松搞定Linux系統(tǒng)中R以及RStudio的安裝Linux系統(tǒng)中安裝R： R可以在大多數(shù)桌面環(huán)境中使用，并且可以適用于不同的操作系統(tǒng)。對(duì)于Windows操作系統(tǒng)而言，安裝R十分的方便，通過訪問...
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如何將轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)mapping到自己的序列并可視化？(HISAT2+Samtools+IGV)以小編自己最近在做的HBV mapping為例，前期的環(huán)境部署及軟件安裝找時(shí)間再細(xì)說，直接進(jìn)入主題，如下： 前期準(zhǔn)備： Linux以及W...
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干貨 | 全基因組CRISPR文庫篩選數(shù)據(jù)分析——MAGeCKFlute近年來，全基因組CRISPR文庫篩選技術(shù)被廣泛應(yīng)用于腫瘤及病毒相關(guān)調(diào)控因子篩選。通過同時(shí)sgRNA文庫同時(shí)敲除全基因組的不同基因，經(jīng)流式或藥物篩...