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植物科研效率迎來 “加速度”！SPDEv3.0 重磅發(fā)布，全自動(dòng)化整合平臺(tái)破解多領(lǐng)域數(shù)據(jù)難題近日，由中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院、浙江大學(xué)、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所等多家科研機(jī)構(gòu)聯(lián)合開發(fā)的SPDEv3.0 多學(xué)科整合數(shù)據(jù)分析平臺(tái)正式亮相...
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SPDEv3.0---三小時(shí)內(nèi)完成基因家族的基本分析最近對(duì)SPDE完成了更新。在新的版本中，我進(jìn)一步提高了自動(dòng)化程度。在基因家族分析方面，可以在三個(gè)小時(shí)內(nèi)完成家族成員的識(shí)別、序列的提取、可視化等過...
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pfam文件的下載方法pfam本來有自己的官網(wǎng)（http://pfam-legacy.xfam.org/）。但這兩年pfam與interpro網(wǎng)站（https...
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CIDP---啟動(dòng)子，基因全長以及CDS序列提取因?yàn)镃IDP需要目的序列，對(duì)于沒有生信基礎(chǔ)的同學(xué)來說從基因組提取序列是一個(gè)相對(duì)痛苦的過程。所以給同學(xué)們?cè)O(shè)置了序列提取模塊。請(qǐng)同學(xué)們進(jìn)行軟件安裝以...
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CIDP---為sgRNA/guide RNA設(shè)計(jì)引物基本過程是設(shè)計(jì)完sgRNA后需要將sgRNA插入到載體序列中，這個(gè)時(shí)候就涉及到了插入哪個(gè)位點(diǎn)的問題。因?yàn)橥瑢W(xué)們手中可能有各種各樣的載體，所以在這...
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CIDP---CRISPR sgRNA設(shè)計(jì)模塊各位老師、同學(xué)，大家好，今天向大家推出一款我最新開發(fā)的、用于CRIPSR系統(tǒng)中sgRNA設(shè)計(jì)的軟件，CIDP。 還是老規(guī)矩，首先向同學(xué)們介紹為什...
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基因組比對(duì)及T2T kmer可視化軟件---RAviz功能介紹老規(guī)矩，先和同學(xué)們介紹一下為什么要做這么一款軟件？基因組比對(duì)paf格式文件： 當(dāng)同學(xué)們需要進(jìn)行基因組層面的序列比較時(shí)，通常要面對(duì)如上所示的比對(duì)結(jié)...
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GFAP---pfam_go_kegg模塊后來發(fā)現(xiàn)，即便努力實(shí)現(xiàn)了各科代表物種的注釋，但在某些情況下還是直接注釋可能更方便些。于是對(duì)GFAP添加了一個(gè)新的模塊，該模塊直接用pfam, G...
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GFAP---關(guān)于版本的漢化
早年用一些外國軟件的時(shí)候總是希望能夠找到漢化版本，到自己做軟件了，反而忽視了這個(gè)問題。既然本照著為同學(xué)們解決問題的原則，今天終于將GFAP進(jìn)行了...