KEGG通路數(shù)據(jù)庫(kù)將通路分成了7個(gè)大類(lèi)，即代謝、遺傳信息處理、環(huán)境信息處理、細(xì)胞過(guò)程、有機(jī)體系統(tǒng)、人類(lèi)疾病、藥物開(kāi)發(fā)。見(jiàn)下圖： [圖片上傳中...(image-45c15f-...
發(fā)簡(jiǎn)信
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資料分享:KEGG通路分類(lèi)表 附下載地址 -
CheckM2終于更新了文章標(biāo)題：CheckM2: a rapid, scalable and accurate tool for assessing microbial genome qualit...
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利用python自NCBI下載fasta和genbank文件
第一部分 自習(xí)室網(wǎng)絡(luò)出奇的差，有時(shí)想打開(kāi)NCBI網(wǎng)頁(yè)下載文件時(shí)會(huì)一直在那里轉(zhuǎn)圈圈，本來(lái)很簡(jiǎn)單的一件事有時(shí)卻要浪費(fèi)好長(zhǎng)時(shí)間；恰好最近在學(xué)習(xí) Bioinformatics wit...
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12-【ncbi-genome-download】的安裝和使用
安裝時(shí)間：2021.2.19 1. 簡(jiǎn)介 ncbi-genome-download是一個(gè)可以直接從NCBI上批量下載序列的軟件，支持下載多種格式。 2. 安裝 利用conda...
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NCBI中編號(hào)/編碼說(shuō)明
【NCBI編號(hào)】NCBI中編號(hào)/編碼說(shuō)明 在日常分析中，我們?cè)贜CBI數(shù)據(jù)中常常見(jiàn)到AC、NC、NM、NR、NP、NG等各類(lèi)編號(hào)，這類(lèi)編號(hào)分別代表著怎樣的含義？我們?cè)撊绾胃鶕?jù)...
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學(xué)習(xí)筆記目錄開(kāi)個(gè)帖子整理一下自己的生信學(xué)習(xí)筆記目錄，方便日后查看：最近更新：2022.07.03 bulk RNA-seq: 實(shí)戰(zhàn)系列: RNA-seq入門(mén)實(shí)戰(zhàn)（零）：RNA-seq流程...
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Day 11 充分理解GSVA和GSEA單個(gè)基因集的GSEA分析 http://software.broadinstitute.org/gsea/msigdb/index.jsp GSEA官網(wǎng)列出關(guān)于msigdb基...
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2021-07-02 clusterProfiler分析GSEAGSEA（Gene Set EnrichmentAnalysis），即基因集富集分析，無(wú)需設(shè)定閾值來(lái)區(qū)分上調(diào)下調(diào)基因，使用所有的基因進(jìn)行分析。 GSEA分析只需要兩列信息，基...
