16年開始做，17年投稿，18年發(fā)表，在當時單細胞技術(shù)比較新
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可視化研究思路很重要！
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一、WES結(jié)果
第一個角度：突變有無
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化療獲益的患者外顯子突變從右到無
化療耐藥的患者外顯子突變沒有完全消失
第二個角度：突變豐度
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MAF，突變豐度，測到的突變的reads/所有測的reads
化療獲益患者突變豐度下降
化療耐藥患者發(fā)現(xiàn)了新突變
亮點
常規(guī)WES平均測序深度為200×（平均每個堿基測200次），深度比較低，臨床上NGS檢測組織1000×，檢測血液ctDNA10000×，高深度測序有利于發(fā)現(xiàn)低豐度的突變
這些新突變，是因為測序深度太低化療前沒測到的突變，在化療后藥物殺死了其他突變的細胞，而有這些突變的細胞獲得優(yōu)勢生長（從少到多，化療的選擇性，化療藥對有這種突變的細胞沒有作用，可以考慮聯(lián)用其他化療藥）；還是化療誘導產(chǎn)生了新突變？（從無到有，化療的副作用）
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5個化療耐藥出現(xiàn)新突變的患者，治療前的樣本用10000×WES
單細胞DNA
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單細胞轉(zhuǎn)錄組
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總結(jié)
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化療治療過程中三種化療藥物誘導產(chǎn)生的腫瘤耐藥進化模型：
D圖1：適應(yīng)性耐藥：是最常見的，一種早期罕見的一種細胞，在化療后，其他細胞被殺死了，這種細胞優(yōu)勢生長
D圖2：獲得性耐藥：化療后，原有的細胞都殺死了，到誘導了一些新細胞出現(xiàn)
D圖3：適應(yīng)性+獲得性
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縱向（時間）對比：治療前中后
橫向?qū)Ρ龋韩@益和不獲益患者，不同的組學
