最近實(shí)在太忙了，好久沒有更新我們的簡書了，今天抽空無論如何也要更新。 示例：查詢PDCD1在各個(gè)泛癌細(xì)胞系中表達(dá)情況。 首先我們打開我們的CCLE數(shù)據(jù)庫上網(wǎng)頁，網(wǎng)址走起，如果...
發(fā)簡信
IP屬地：浙江
-
CCLE查詢基因在細(xì)胞系中表達(dá) -
單基因TCGA的Cox森林圖怎么畫才好看首先調(diào)取Xena網(wǎng)頁的TCGA數(shù)據(jù)做Cox生存分析，數(shù)據(jù)可以通過hiplot官網(wǎng)自主研發(fā)的ucsc-xena-shiny直接在線獲取訪問https://hiplot.com....
-
-
HPA數(shù)據(jù)庫概要（Human Protein Atlas）HPA數(shù)據(jù)庫（Human Protein Atlas）是基于蛋白組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué)以及系統(tǒng)生物學(xué)數(shù)據(jù)，可以繪制組織、細(xì)胞、器官等圖譜。不僅收錄了腫瘤組織，也涵蓋了正常組織的蛋白表...
-
示例：利用HPA數(shù)據(jù)庫搜索血液中不同免疫細(xì)胞PD1表達(dá)情況PD-1（程序性死亡分子1），有PDCD1基因編碼，是一種重要的免疫抑制分子。之前我們對HPA數(shù)據(jù)庫進(jìn)行的簡介，這里我們將利用HPA數(shù)據(jù)庫示例，搜索血液中不同免疫細(xì)胞PD1基...
-
DAVID數(shù)據(jù)庫簡介及使用說明很高興今天給大家介紹DAVID數(shù)據(jù)庫，因?yàn)镈AVID不僅是個(gè)生物數(shù)據(jù)庫，也是一款在線分析軟件?？梢杂脕碜龌虻牟町惙治?，也可用于通路的富集。他可以將輸入列表中的基因，關(guān)聯(lián)到生...
-
GEO2R instruction
GEO2R instruction 前段時(shí)間使用時(shí)，發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)對不上，后來才知道2020年11月GEO2R改版，如果要復(fù)現(xiàn)，需要對設(shè)置的組進(jìn)行反轉(zhuǎn)。于是乎，今天把GEO2R的指...
-
利用String數(shù)據(jù)庫和Cytoscape軟件繪制蛋白交互網(wǎng)絡(luò)（PPI）Summary String數(shù)據(jù)庫:https://www.string-db.org 是研究網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)中蛋白質(zhì)相互作用的一個(gè)常用數(shù)據(jù)庫，截止今天，已經(jīng)更新到11.0版本。 ...
