最近實在太忙了，好久沒有更新我們的簡書了，今天抽空無論如何也要更新。 示例：查詢PDCD1在各個泛癌細胞系中表達情況。 首先我們打開我們的CCLE數(shù)據(jù)庫上網(wǎng)頁，網(wǎng)址走起，如果...
發(fā)簡信
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CCLE查詢基因在細胞系中表達 -
單基因TCGA的Cox森林圖怎么畫才好看首先調(diào)取Xena網(wǎng)頁的TCGA數(shù)據(jù)做Cox生存分析，數(shù)據(jù)可以通過hiplot官網(wǎng)自主研發(fā)的ucsc-xena-shiny直接在線獲取訪問https://hiplot.com....
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GWAS - 3 多種算法結果的結合處理算法 （補充）無意看到一篇中文文章，并且寫出了多種算法，這里總結一下。 1 得到的數(shù)據(jù)分三種情況 1 完全列表（full list, FL）: 得到的各結果為完整SNP列表（并且每個為1個...
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Seurat4.0系列教程4：整合分析scRNA-seq整合簡介 對兩個或兩個以上單細胞數(shù)據(jù)集的整合分析提出了獨特的挑戰(zhàn)。特別是，在標準工作流下，識別存在于多個數(shù)據(jù)集中的基因可能存在問題。Seurat v4 包括...
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘筆記1生信技能樹2021數(shù)據(jù)挖掘線上課筆記，需要結合課程講解服用 TCGA下載數(shù)據(jù)的方法-gdc-client（軟件名）：需要寫命令運行，官方下載的數(shù)據(jù)，下載的數(shù)據(jù)是零散的，每個病...
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ggplot2繪制一個高端的venn圖
venn圖在論文中的作用與地位也許不如其它圖形那么重要，因此本文主要不是教大家如何畫一個高端的venn圖，而是通過整個畫圖過程中的代碼來介紹一些重要的畫圖函數(shù)而已，希望各位觀...
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利用String數(shù)據(jù)庫和Cytoscape軟件繪制蛋白交互網(wǎng)絡（PPI）Summary String數(shù)據(jù)庫:https://www.string-db.org 是研究網(wǎng)絡藥理學中蛋白質相互作用的一個常用數(shù)據(jù)庫，截止今天，已經(jīng)更新到11.0版本。 ...
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手把手教你繪制火山圖前面我通過視頻給大家講解過?火山圖怎么看[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3F__biz...
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引物設計原則 及 Primer Premier 6 批量引物設計本文來源：互聯(lián)網(wǎng)，侵權刪 篇一：引物設計原則 剛做實驗的同學，很多時候希望別人幫自己設計好引物，其實這種方式是不可取的，首先是高估了引物設計 的難度，其次也自己的實驗別人了解...
